Gli amminoacidi sono costituiti da una parte comune e da una variabile ovvero il gruppo R. Gli amminoacidi con R apolare sono quelli composti da una catena ibrofoba cioè che non contiene gruppi polari e sono per esempio glicina, prolina e fenilalanina. Gli amminoacidi con R polare neutro sono quelli i cui gruppi funzionali formano ponti idrogeno e sono quindi solubili in acqua.
Gli amminoacidi con R carico positivamente sono: lisina, arginina e istidina. Gli amminoacidi con R carico negativamente sono: acido glutammico e acido aspartico.
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