I sintomi del botulismo compaiono di solito dopo circa 18-36 ore dall'ingestione; le tossine, che non vengono distrutte dagli enzimi digestivi dell'apparato digerente ma sono interamente assorbite all'interno dell'organismo, compromettono il funzionamento del sistema nervoso centrale. Ne derivano sintomi che vanno dalla comparsa di nausea e vomito e dolori addominali, alla difficoltà di deambulazione e deglutizione, al deterioramento della vista e del linguaggio, alle convulsioni, fino alla paralisi dei muscoli respiratori, che comporta la morte per asfissia. Dai primi sintomi al decesso possono passare da poche ore a qualche giorno, secondo la quantità di tossina ingerita.
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